Do zadań Apteki Szpitalnej należą:

• Zaopatrywanie oddziałów, pracowni i poradni w produkty lecznicze i wyroby medyczne;
• Sporządzanie leków recepturowych i aptecznych;
• Przygotowywanie leków cytostatycznych w dawkach dziennych;
• Organizowanie zaopatrzenia szpitala w produkty lecznicze i wyroby medyczne;
• Prowadzenie komputerowej ewidencji produktów leczniczych i wyrobów medycznych;
• Udział w racjonalizacji farmakoterapii;
• Udzielanie informacji o produktach leczniczych i wyrobach medycznych;
• Monitorowanie bezpieczeństwa farmakoterapii (zgłaszanie działań niepożądanych lub podejrzeń dotyczących jakości leku, wstrzymywanie lub wycofywanie leków z obrotu);
• Prowadzenie ewidencji próbek lekarskich i uzyskiwanych darów produktów leczniczych.
• Kierownik Apteki uczestniczy w pracach Komitetu Terapeutycznego rozpatrującego wszystkie sprawy związane z farmakoterapią pacjentów szpitala. Analizuje również leczenie przeciwbakteryjne w szpitalu, uczestnicząc w pracach Komitetu ds. Zakażeń.

Apteka Szpitalna zgodnie z zapisem Prawa Farmaceutycznego sporządza leki cytotoksyczne w dawkach dziennych dla pacjentów. Aby sprostać temu zadaniu, stworzona została Pracownia Leku Cytotoksycznego. Produkcja zorganizowana została zgodnie z wymogami polskiego prawa, najnowszych standardów PTF oraz z uwzględnieniem zasad GMP. Fachowo przygotowany personel Apteki, a także wysokiej klasy sprzęt zapewniają wysoki poziom świadczonych usług farmaceutycznych.